DMR 11333 chr1:247595351-247595550 (200bp)

DMR Stats
Positionchr1:247595351-247595550 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesNLRP3 (0bp away)
ANODEV p-value0.0128840342501
FrequenciesBenign: 1.0 (14.29%), Low: 0.0 (0.0%), High: 2.0 (22.22 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
11333 NLRP3 2817 uc001icr.3 chr1 247579458 247612406 + 200 100.0 0.69 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
11333 NLRP3 2817 uc001ics.3 chr1 247579458 247612406 + 200 100.0 0.52 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
11333 NLRP3 2817 uc001icu.3 chr1 247581355 247612406 + 200 100.0 0.24 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
11333 NLRP3 2817 uc001icv.3 chr1 247581355 247612406 + 200 100.0 0.32 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0) 0.0
11333 NLRP3 2817 uc001icw.3 chr1 247581355 247612406 + 200 100.0 0.24 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
11333 NLRP3 2817 uc010pyw.2 chr1 247581355 247612406 + 200 100.0 0.47 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
  • 6 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
11333 chr1 247594916 247595373 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 CTCF score:717, expCount:13, expNums:9,24,290,493,612,621,631,645,663,679,680,681,687, expScores:156,362,119,717,128,438,222,137,103,133,129,121,139, srow:437005
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
11333 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 1, DU145: 6
11333 cellexp id=ENSG00000162711, name=NLRP3, PrEC=44, str=203, LNCaP=0, str=3, DU145=10, str=32
11333 tcgaexp gene=NLRP3, entrez=114548, pos=chr1:247579458-247612406(+), B=188, L=131, M=131, H=133