DMR 12641 chr3:48019851-48020000 (150bp)

DMR Stats
Positionchr3:48019851-48020000 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesMAP4 (0bp away)
ANODEV p-value0.0497943221643
FrequenciesBenign: 3.0 (42.86%), Low: 1.0 (16.67%), High: 6.0 (66.67 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
12641 MAP4 20108 uc003csb.2 chr3 47892180 48130769 - 150 100.0 1.76 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0) 0.0
12641 MAP4 20108 uc003csc.3 chr3 47892180 48130769 - 150 100.0 4.61 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
12641 MAP4 20108 uc003csf.3 chr3 47952553 48130769 - 150 100.0 1.76 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
12641 MAP4 20108 uc003csg.3 chr3 48014569 48130769 - 150 100.0 4.29 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0) 0.0
12641 MAP4 20108 uc011bbf.1 chr3 47917175 48130769 - 150 100.0 0.59 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
  • 5 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
12641 chr3 48019961 48020355 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 8 score:323, srow:804738
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
12641 cellmeth_recounts PrEC: 4, LNCaP: 5, DU145: 4
12641 cellexp id=ENSG00000047849, name=MAP4, PrEC=41204, str=46729, LNCaP=22759, str=19944, DU145=27993, str=25890
12641 tcgaexp gene=MAP4, entrez=4134, pos=chr3:47892180-48130769(-), B=18640, L=16030, M=14202, H=15648