DMR 23468 chr20:5557851-5558000 (150bp)

DMR Stats
Positionchr20:5557851-5558000 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesGPCPD1 (0bp away)
ANODEV p-value0.0498934385559
FrequenciesBenign: 4.0 (57.14%), Low: 1.0 (16.67%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
23468 GPCPD1 17978 uc002wmd.4 chr20 5525080 5566683 - 150 100.0 0.45 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
23468 GPCPD1 17978 uc002wme.4 chr20 5525080 5591672 - 150 100.0 0.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (100), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0) 0.0
  • 2 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
23468 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 1, DU145: 0
23468 cellexp id=ENSG00000125772, name=GPCPD1, PrEC=3723, str=2049, LNCaP=941, str=857, DU145=483, str=1064
23468 tcgaexp gene=GPCPD1, entrez=56261, pos=chr20:5525080-5591672(-), B=2467, L=1659, M=1599, H=1540