DMR 42929 chr1:247597651-247597800 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:247597651-247597800 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesNLRP3 (0bp away)
ANODEV p-value0.0329936065703
FrequenciesBenign: 7.0 (100.0%), Low: 6.0 (100.0%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
42929 NLRP3 2817 uc001icr.3 chr1 247579458 247612406 + 150 100.0 0.08 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
42929 NLRP3 2817 uc001ics.3 chr1 247579458 247612406 + 150 100.0 0.08 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
42929 NLRP3 2817 uc001icu.3 chr1 247581355 247612406 + 150 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
42929 NLRP3 2817 uc001icv.3 chr1 247581355 247612406 + 150 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0) 0.0
42929 NLRP3 2817 uc001icw.3 chr1 247581355 247612406 + 150 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
42929 NLRP3 2817 uc010pyw.2 chr1 247581355 247612406 + 150 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
  • 6 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
42929 chr1 247597346 247597795 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 5 score:858, srow:119613
42929 chr1 247597381 247597704 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 CEBPB score:181, expCount:3, expNums:212,426,477, expScores:169,169,181, srow:437006
  • 2 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
42929 cellmeth_recounts PrEC: 5, LNCaP: 0, DU145: 3
42929 cellexp id=ENSG00000162711, name=NLRP3, PrEC=44, str=203, LNCaP=0, str=3, DU145=10, str=32
42929 tcgaexp gene=NLRP3, entrez=114548, pos=chr1:247579458-247612406(+), B=188, L=131, M=131, H=133