DMR 47 chr1:3759551-3759750 (200bp)

DMR Stats
Positionchr1:3759551-3759750 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesCEP104 (0bp away)
ANODEV p-value0.00875114195483
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 1.0 (16.67%), High: 0.0 (0.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
47 CEP104 129 uc001aky.2 chr1 3728645 3773797 - 200 100.0 0.61 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0) 0.0
47 CEP104 129 uc001akz.3 chr1 3750235 3773797 - 200 100.0 0.61 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
47 CEP104 129 uc010nzm.1 chr1 3728653 3773797 - 200 100.0 0.83 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
47 chr1 3759750 3760118 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 SPI1 score:255, expCount:2, expNums:107,126, expScores:255,159, srow:10844
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
47 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 1, DU145: 1
47 cellexp id=ENSG00000116198, name=CEP104, PrEC=3623, str=2993, LNCaP=2992, str=2909, DU145=599, str=427
47 tcgaexp gene=CEP104, entrez=9731, pos=chr1:3728645-3773797(-), B=2236, L=2049, M=2022, H=2232
47 tcgaexp gene=SRSF10, entrez=10772, pos=chr1:36273-24306953(-), B=3487, L=3388, M=3432, H=4019
47 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305