DMR 9842 chrX:10090651-10090850 (200bp)

DMR Stats
PositionchrX:10090651-10090850 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextexon
Nearest GenesWWC3 (0bp away)
ANODEV p-value0.0498192643906
FrequenciesBenign: 6.0 (85.71%), Low: 6.0 (100.0%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
9842 WWC3 30531 uc004csx.4 chrX 9983795 10112518 + 200 100.0 0.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (4), E12 (60.5), I12 (36), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0) 0.0
9842 WWC3 30531 uc010nds.3 chrX 9983795 10112518 + 200 100.0 0.14 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (4), E13 (60.5), I13 (36), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0) 0.0
9842 WWC3 30531 uc010ndt.3 chrX 10047765 10112518 + 200 100.0 0.16 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (4), E9 (60.5), I9 (36), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
9842 chrX 10090698 10090698 cosmic COSM1464406 srow:1229490
9842 chrX 10090717 10090717 cosmic COSM278146 srow:1229491
9842 chrX 10090724 10090724 cosmic COSM1111940 srow:1229492
9842 chrX 10090748 10090748 cosmic COSM130233 srow:1229493
9842 chrX 10090779 10090779 cosmic COSM1464407 srow:1229494
9842 chrX 10090653 10090671 phastConsElements100way lod=130 score:475, srow:9555670
9842 chrX 10090673 10090680 phastConsElements100way lod=76 score:422, srow:9555671
9842 chrX 10090682 10090683 phastConsElements100way lod=16 score:268, srow:9555672
9842 chrX 10090685 10090704 phastConsElements100way lod=154 score:492, srow:9555673
9842 chrX 10090706 10090710 phastConsElements100way lod=34 score:343, srow:9555674
9842 chrX 10090712 10090716 phastConsElements100way lod=47 score:375, srow:9555675
9842 chrX 10090718 10090719 phastConsElements100way lod=19 score:285, srow:9555676
9842 chrX 10090721 10090728 phastConsElements100way lod=70 score:414, srow:9555677
9842 chrX 10090730 10090737 phastConsElements100way lod=72 score:417, srow:9555678
9842 chrX 10090739 10090743 phastConsElements100way lod=60 score:399, srow:9555679
9842 chrX 10090745 10090758 phastConsElements100way lod=143 score:485, srow:9555680
9842 chrX 10090760 10090786 phastConsElements100way lod=230 score:532, srow:9555681
9842 chrX 10090051 10092050 cpgShelf — values(x.gr)[overs$srow, ]:42243
  • 18 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
9842 cellmeth_recounts PrEC: 24, LNCaP: 3, DU145: 3
9842 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=43, B=5, Length=380, Event=Down, log2FC=-3.1, padj=2.94989167350022e-07
9842 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=43, B=3, Length=380, Event=Down, log2FC=-3.84, padj=1.21014621758047e-08
9842 cellexp id=ENSG00000047644, name=WWC3, PrEC=2865, str=1887, LNCaP=2456, str=1760, DU145=2146, str=804
9842 tcgaexp gene=WWC3, entrez=55841, pos=chrX:9983795-10112518(+), B=5659, L=2466, M=2410, H=2424