DMR Stats
Positionchr1:1605701-1605850 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesCDK11B, SLC35E2B (0bp away)
ANODEV p-value0.00869016871973
FrequenciesBenign: 7.0 (100.0%), Low: 6.0 (100.0%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
14 SLC35E2B 82 uc021oeu.1 chr1 1601214 1608285 - 150 100.0 0.58 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0) 0.0
14 SLC35E2B 82 uc001ahf.4 chr1 1592939 1624243 - 150 100.0 0.43 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
14 SLC35E2B 82 uc001ahg.4 chr1 1592939 1624243 - 150 100.0 0.43 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
14 SLC35E2B 82 uc009vkl.2 chr1 1590988 1624243 - 150 100.0 0.43 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0) 0.0
14 SLC35E2B 82 uc009vkn.2 chr1 1601877 1624243 - 150 100.0 0.43 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0) 0.0
14 CDK11B 80 uc001ags.1 chr1 1571100 1647917 - 150 100.0 0.42 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0) 0.0
14 CDK11B 80 uc001agt.1 chr1 1571100 1647917 - 150 100.0 0.42 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
14 CDK11B 80 uc001agv.1 chr1 1571100 1655775 - 150 100.0 2.23 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0) 0.0
14 CDK11B 80 uc001agw.1 chr1 1571100 1655775 - 150 100.0 1.93 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0) 0.0
14 CDK11B 80 uc001agx.1 chr1 1571100 1655775 - 150 100.0 1.45 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0) 0.0
14 CDK11B 80 uc001agy.1 chr1 1571100 1655775 - 150 100.0 1.45 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0) 0.0
14 CDK11B 80 uc001agz.1 chr1 1571100 1655775 - 150 100.0 0.58 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
14 CDK11B 80 uc001aha.1 chr1 1571100 1655775 - 150 100.0 0.58 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (100), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0) 0.0
14 SLC35E2B 82 uc001ahh.4 chr1 1592939 1677438 - 150 100.0 0.58 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
  • 14 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
14 chr1 1605401 1605772 phastConsElements100way lod=1954 score:744, srow:7925
14 chr1 1605774 1605840 phastConsElements100way lod=381 score:582, srow:7926
14 chr1 1605846 1605860 phastConsElements100way lod=41 score:361, srow:7927
14 chr1 1604687 1605898 cpgShelf values(x.gr)[overs$srow, ]:108
  • 4 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
14 cellmeth_recounts PrEC: 17, LNCaP: 1, DU145: 3
14 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=33, B=1, Length=380, Event=Down, log2FC=-5.04, padj=4.92420918598239e-08
14 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=33, B=2, Length=380, Event=Down, log2FC=-4.04, padj=7.30493295329325e-07
14 cellexp id=ENSG00000189339, name=SLC35E2B, PrEC=2231, str=3553, LNCaP=8155, str=4825, DU145=2480, str=1551
14 cellexp id=ENSG00000269227, name=RP11-345P4.6, PrEC=4, str=7, LNCaP=22, str=12, DU145=10, str=4
14 tcgaexp gene=CDK11B, entrez=984, pos=chr1:1571100-1655775(-), B=2087, L=2105, M=1956, H=1940
14 tcgaexp gene=SRSF10, entrez=10772, pos=chr1:36273-24306953(-), B=3487, L=3388, M=3432, H=4019
14 tcgaexp gene=SLC35E2B, entrez=728661, pos=chr1:1590988-1677438(-), B=5059, L=6323, M=6759, H=6487
14 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305