DMR 10223 chr1:9800951-9801150 (200bp)

DMR Stats
Positionchr1:9800951-9801150 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesCLSTN1 (0bp away)
ANODEV p-value0.000895080852884
FrequenciesBenign: 5.0 (71.43%), Low: 1.0 (16.67%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
10223 CLSTN1 189 uc001aqh.3 chr1 9789079 9884550 - 200 100.0 0.12 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (100), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0) 0.0
10223 CLSTN1 189 uc001aqi.3 chr1 9789079 9884550 - 200 100.0 0.12 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (100), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
10223 CLSTN1 189 uc010oag.2 chr1 9789079 9884550 - 200 100.0 0.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (100), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
10223 chr1 9801149 9801161 phastConsElements100way lod=197 score:516, srow:35615
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
10223 cellmeth_recounts PrEC: 6, LNCaP: 0, DU145: 0
10223 cellexp id=ENSG00000171603, name=CLSTN1, PrEC=41825, str=115801, LNCaP=21400, str=18325, DU145=12597, str=14891
10223 tcgaexp gene=SRSF10, entrez=10772, pos=chr1:36273-24306953(-), B=3487, L=3388, M=3432, H=4019
10223 tcgaexp gene=CLSTN1, entrez=22883, pos=chr1:9789079-9884550(-), B=24900, L=28852, M=28857, H=25563
10223 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305