DMR 10285 chr1:15621301-15621450 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:15621301-15621450 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesFHAD1 (0bp away)
ANODEV p-value0.0315629523703
FrequenciesBenign: 5.0 (71.43%), Low: 2.0 (33.33%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
10285 FHAD1 269 uc001awa.1 chr1 15573768 15672019 + 150 100.0 0.81 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0) 0.0
10285 FHAD1 269 uc001awb.2 chr1 15573768 15724622 + 150 100.0 0.49 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0) 0.0
  • 2 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
10285 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 1, DU145: 1
10285 cellexp id=ENSG00000142621, name=FHAD1, PrEC=33, str=11, LNCaP=20, str=19, DU145=122, str=134
10285 tcgaexp gene=SRSF10, entrez=10772, pos=chr1:36273-24306953(-), B=3487, L=3388, M=3432, H=4019
10285 tcgaexp gene=FHAD1, entrez=114827, pos=chr1:15573768-15726778(+), B=40, L=16, M=28, H=33
10285 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305