DMR 10467 chr1:32200651-32200950 (300bp)

DMR Stats
Positionchr1:32200651-32200950 (View on UCSC)
Width300bp
Genomic Contextexon
Nearest GenesBAI2 (0bp away)
ANODEV p-value0.00322146680669
FrequenciesBenign: 5.0 (71.43%), Low: 1.0 (16.67%), High: 7.0 (77.78 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
10467 BAI2 574 uc001btn.3 chr1 32192718 32229648 - 300 100.0 0.23 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (23), E25 (33), I25 (44.33), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0) 0.0
10467 BAI2 574 uc001bto.3 chr1 32192718 32229648 - 300 100.0 0.23 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (23), E25 (33), I25 (44.33), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0) 0.0
10467 BAI2 574 uc001btp.1 chr1 32192719 32202280 - 300 100.0 0.31 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (55.67), I3 (44.33), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
10467 BAI2 574 uc010ogn.2 chr1 32192718 32202324 - 300 100.0 0.23 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
10467 BAI2 574 uc010ogo.2 chr1 32192718 32210332 - 300 100.0 0.31 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (100), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0) 0.0
10467 BAI2 574 uc010ogp.2 chr1 32192718 32222416 - 300 100.0 0.31 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (23), E21 (33), I21 (44.33), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0) 0.0
10467 BAI2 574 uc010ogq.2 chr1 32192718 32222882 - 300 100.0 0.23 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (100), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0) 0.0
  • 7 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
10467 chr1 32199746 32200855 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 32 score:1000, srow:26089
10467 chr1 32200866 32201175 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 6 score:472, srow:26090
10467 chr1 32200685 32200695 tfbsConsSites V$SREBP1_02 score:814, zScore:1.71, srow:68330
10467 chr1 32200743 32200757 tfbsConsSites V$SPZ1_01 score:888, zScore:2.07, srow:68331
10467 chr1 32200751 32200762 tfbsConsSites V$PAX4_03 score:932, zScore:2.11, srow:68332
10467 chr1 32200754 32200767 tfbsConsSites V$RREB1_01 score:893, zScore:3.04, srow:68333
10467 chr1 32200755 32200767 tfbsConsSites V$SP1_Q6 score:907, zScore:1.83, srow:68334
10467 chr1 32200757 32200765 tfbsConsSites V$ZIC2_01 score:883, zScore:1.67, srow:68335
10467 chr1 32200786 32200798 tfbsConsSites V$IK3_01 score:898, zScore:2.61, srow:68336
10467 chr1 32200812 32200826 tfbsConsSites V$SPZ1_01 score:875, zScore:1.86, srow:68337
10467 chr1 32200852 32200879 tfbsConsSites V$PAX5_02 score:788, zScore:2.11, srow:68338
10467 chr1 32200862 32200873 tfbsConsSites V$AREB6_03 score:906, zScore:2.17, srow:68339
10467 chr1 32200932 32200946 tfbsConsSites V$TAXCREB_02 score:749, zScore:1.75, srow:68340
10467 chr1 32200934 32200943 tfbsConsSites V$GATA1_01 score:964, zScore:2.15, srow:68341
10467 chr1 32200934 32200943 tfbsConsSites V$GATA2_01 score:945, zScore:1.81, srow:68342
10467 chr1 32200935 32200943 tfbsConsSites V$GATA3_01 score:960, zScore:2.37, srow:68343
10467 chr1 32200936 32200958 tfbsConsSites V$PPARG_02 score:686, zScore:1.75, srow:68344
10467 chr1 32200815 32200815 cosmic COSM1341754 srow:19874
10467 chr1 32200815 32200815 cosmic COSM1341755 srow:19875
10467 chr1 32200855 32200855 cosmic COSM403584 srow:19876
10467 chr1 32200667 32200668 phastConsElements100way lod=12 score:240, srow:130328
10467 chr1 32200681 32200692 phastConsElements100way lod=23 score:304, srow:130329
10467 chr1 32200713 32200715 phastConsElements100way lod=14 score:255, srow:130330
10467 chr1 32200719 32200734 phastConsElements100way lod=30 score:330, srow:130331
10467 chr1 32200770 32200888 phastConsElements100way lod=1050 score:682, srow:130332
  • Page 1 of 2
  • 25 of 32 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
10467 cellmeth_recounts PrEC: 46, LNCaP: 6, DU145: 10
10467 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=69, B=5, Length=420, Event=Down, log2FC=-3.79, padj=5.27225910576948e-14
10467 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=69, B=6, Length=440, Event=Down, log2FC=-3.52, padj=4.78334101268918e-13
10467 cellexp id=ENSG00000121753, name=BAI2, PrEC=251, str=341, LNCaP=385, str=106, DU145=2374, str=1298
10467 tcgaexp gene=BAI2, entrez=576, pos=chr1:32192718-32229648(-), B=475, L=333, M=249, H=225
10467 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305