DMR 10710 chr1:78135351-78135500 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:78135351-78135500 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesZZZ3 (0bp away)
ANODEV p-value0.0181673978418
FrequenciesBenign: 6.0 (85.71%), Low: 2.0 (33.33%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
10710 ZZZ3 1060 uc001dhq.3 chr1 78030190 78148343 - 150 100.0 0.01 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
10710 ZZZ3 1060 uc001dhr.3 chr1 78030190 78149104 - 150 100.0 0.01 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
10710 ZZZ3 1060 uc009wbz.1 chr1 78050202 78148343 - 150 100.0 0.01 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
10710 cellmeth_recounts PrEC: 3, LNCaP: 6, DU145: 5
10710 cellexp id=ENSG00000036549, name=ZZZ3, PrEC=3691, str=2856, LNCaP=3491, str=3891, DU145=3089, str=3381
10710 tcgaexp gene=ZZZ3, entrez=26009, pos=chr1:78030190-78149104(-), B=2213, L=2190, M=2210, H=2417
10710 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305