DMR 11001 chr1:182503651-182503800 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:182503651-182503800 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesRGSL1 (0bp away)
ANODEV p-value0.00112450813214
FrequenciesBenign: 6.0 (85.71%), Low: 2.0 (33.33%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
11001 RGSL1 2263 uc009wxw.3 chr1 182419256 182529732 + 150 100.0 4.8 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (100), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0) 0.0
11001 RGSL1 2263 uc009wxx.2 chr1 182457420 182529732 + 150 100.0 4.35 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (100), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
11001 RGSL1 2263 uc010pnu.1 chr1 182419256 182523828 + 150 100.0 5.83 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (100), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
11001 cellmeth_recounts PrEC: 3, LNCaP: 6, DU145: 4
11001 cellexp id=ENSG00000121446, name=RGSL1, PrEC=1, str=0, LNCaP=0, str=1, DU145=0, str=0
11001 tcgaexp gene=RGSL1, entrez=353299, pos=chr1:182419256-182529732(+), B=0, L=0, M=0, H=1