DMR 11095 chr1:204955051-204955200 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:204955051-204955200 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextpromoter
Nearest GenesNFASC (0bp away)
ANODEV p-value0.00837420519834
FrequenciesBenign: 5.0 (71.43%), Low: 1.0 (16.67%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
11095 NFASC 2437 uc001hbi.3 chr1 204797782 204991950 + 150 100.0 0.43 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (100), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0) 0.0
11095 NFASC 2437 uc001hbj.3 chr1 204797782 204991950 + 150 100.0 0.47 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (100), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0) 0.0
11095 NFASC 2437 uc001hbk.1 chr1 204926784 204959691 + 150 100.0 0.9 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (100), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0) 0.0
11095 NFASC 2437 uc001hbl.2 chr1 204950926 204991950 + 150 100.0 0.42 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0) 0.0
11095 NFASC 2437 uc010pra.2 chr1 204797782 204991950 + 150 100.0 20.18 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (100), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0) 0.0
11095 NFASC 2437 uc010prb.2 chr1 204913354 204991950 + 150 100.0 22.58 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (100), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0) 0.0
11095 NFASC 2437 uc010prc.2 chr1 204913354 204991950 + 150 100.0 1.11 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (100), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0) 0.0
  • 7 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
11095 chr1 204954726 204955270 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 5 score:274, srow:96555
11095 chr1 204955092 204955121 tfbsConsSites V$PAX4_04 score:733, zScore:1.82, srow:424800
11095 chr1 204955096 204955115 tfbsConsSites V$YY1_02 score:765, zScore:1.71, srow:424801
11095 chr1 204955102 204955123 tfbsConsSites V$OLF1_01 score:804, zScore:1.84, srow:424802
11095 chr1 204955104 204955120 tfbsConsSites V$RFX1_01 score:836, zScore:2.03, srow:424803
11095 chr1 204955126 204955135 tfbsConsSites V$SP1_01 score:924, zScore:1.68, srow:424804
11095 chr1 204955178 204955191 tfbsConsSites V$SOX9_B1 score:867, zScore:1.9, srow:424805
11095 chr1 204955130 204955130 cosmic COSM902682 srow:102862
11095 chr1 204955186 204955186 cosmic COSM902683 srow:102863
11095 chr1 204955012 204955098 phastConsElements100way lod=728 score:646, srow:727157
11095 chr1 204955104 204955109 phastConsElements100way lod=57 score:394, srow:727158
11095 chr1 204955113 204955114 phastConsElements100way lod=28 score:323, srow:727159
11095 chr1 204955116 204955120 phastConsElements100way lod=47 score:375, srow:727160
11095 chr1 204955126 204955126 phastConsElements100way lod=21 score:295, srow:727161
11095 chr1 204955128 204955129 phastConsElements100way lod=27 score:320, srow:727162
11095 chr1 204955132 204955156 phastConsElements100way lod=171 score:502, srow:727163
11095 chr1 204955158 204955189 phastConsElements100way lod=403 score:587, srow:727164
11095 chr1 204955192 204955195 phastConsElements100way lod=44 score:368, srow:727165
11095 chr1 204955197 204955213 phastConsElements100way lod=179 score:507, srow:727166
11095 chr1 204953211 204955210 cpgShelf — values(x.gr)[overs$srow, ]:3327
  • 20 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
11095 cellmeth_recounts PrEC: 6, LNCaP: 0, DU145: 3
11095 cellexp id=ENSG00000163531, name=NFASC, PrEC=218, str=478, LNCaP=179, str=211, DU145=700, str=335
11095 tcgameth site:cg26601496, B=0.74, L=0.76, H=0.74
11095 tcgaexp gene=NFASC, entrez=23114, pos=chr1:204797782-204991950(+), B=1717, L=1078, M=1035, H=1128