DMR 11241 chr1:234548651-234548800 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:234548651-234548800 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesTARBP1 (0bp away)
ANODEV p-value0.0140427179746
FrequenciesBenign: 6.0 (85.71%), Low: 2.0 (33.33%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
11241 TARBP1 2726 uc001hwd.3 chr1 234527059 234614849 - 150 100.0 0.08 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (100), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0) 0.0
  • 1 genes

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
11241 chr1 234548526 234548790 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 2 score:227, srow:113321
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
11241 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 0, DU145: 0
11241 cellexp id=ENSG00000059588, name=TARBP1, PrEC=2678, str=2166, LNCaP=1812, str=1589, DU145=2292, str=2508
11241 tcgaexp gene=TARBP1, entrez=6894, pos=chr1:234527059-234614849(-), B=1100, L=1542, M=1693, H=2072