DMR 11299 chr1:243453401-243453600 (200bp)

DMR Stats
Positionchr1:243453401-243453600 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesSDCCAG8 (0bp away)
ANODEV p-value0.0383513119974
FrequenciesBenign: 5.0 (71.43%), Low: 1.0 (16.67%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
11299 SDCCAG8 2784 uc001hzw.3 chr1 243419307 243663393 + 200 100.0 0.43 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
11299 SDCCAG8 2784 uc001hzx.3 chr1 243449574 243663393 + 200 100.0 1.07 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
11299 SDCCAG8 2784 uc010pyk.2 chr1 243419307 243663393 + 200 100.0 0.14 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
11299 SDCCAG8 2784 uc010pyl.2 chr1 243419307 243663393 + 200 100.0 0.24 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
  • 4 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
11299 chr1 243453595 243453604 phastConsElements100way lod=17 score:274, srow:849609
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
11299 cellmeth_recounts PrEC: 3, LNCaP: 0, DU145: 6
11299 cellexp id=ENSG00000054282, name=SDCCAG8, PrEC=2414, str=1935, LNCaP=1486, str=995, DU145=657, str=1023
11299 tcgaexp gene=SDCCAG8, entrez=10806, pos=chr1:243419307-243663393(+), B=1210, L=1168, M=1122, H=1118