DMR 114 chr1:12051901-12052050 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:12051901-12052050 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesMFN2 (0bp away)
ANODEV p-value0.0402417297649
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 1.0 (16.67%), High: 0.0 (0.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
114 MFN2 227 uc001atn.4 chr1 12040238 12073572 + 150 100.0 3.18 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0) 0.0
114 MFN2 227 uc009vni.3 chr1 12040238 12073572 + 150 100.0 3.42 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
  • 2 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
114 chr1 12052006 12052255 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 3 score:187, srow:9929
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
114 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 0, DU145: 8
114 cellexp id=ENSG00000116688, name=MFN2, PrEC=22304, str=12627, LNCaP=10189, str=12603, DU145=10099, str=12043
114 tcgaexp gene=MFN2, entrez=9927, pos=chr1:12040238-12073572(+), B=10001, L=7771, M=6891, H=6719
114 tcgaexp gene=SRSF10, entrez=10772, pos=chr1:36273-24306953(-), B=3487, L=3388, M=3432, H=4019
114 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305