DMR 12418 chr2:241666351-241666550 (200bp)

DMR Stats
Positionchr2:241666351-241666550 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextpromoter
Nearest GenesKIF1A (0bp away)
ANODEV p-value9.25798456701e-05
FrequenciesBenign: 6.0 (85.71%), Low: 0.0 (0.0%), High: 7.0 (77.78 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
12418 KIF1A 17832 uc002vzz.2 chr2 241662830 241759725 - 200 100.0 0.94 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0), I36 (0), E37 (0), I37 (0), E38 (0), I38 (0), E39 (0), I39 (97), E40 (3.5), I40 (0), E41 (0), I41 (0), E42 (0), I42 (0), E43 (0) 0.0
12418 KIF1A 17832 uc010fzk.3 chr2 241653181 241759725 - 200 100.0 1.65 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0), I36 (0), E37 (0), I37 (0), E38 (0), I38 (97), E39 (3.5), I39 (0), E40 (0), I40 (0), E41 (0), I41 (0), E42 (0), I42 (0), E43 (0), I43 (0), E44 (0), I44 (0), E45 (0), I45 (0), E46 (0), I46 (0), E47 (0), I47 (0), E48 (0), I48 (0), E49 (0) 0.0
12418 KIF1A 17832 uc031rsb.1 chr2 241653181 241737229 - 200 100.0 1.41 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (97), E36 (3.5), I36 (0), E37 (0), I37 (0), E38 (0), I38 (0), E39 (0), I39 (0), E40 (0), I40 (0), E41 (0), I41 (0), E42 (0), I42 (0), E43 (0), I43 (0), E44 (0), I44 (0), E45 (0), I45 (0), E46 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
12418 chr2 241666365 241666960 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 ZNF263 score:392, expCount:1, expNums:368, expScores:392, srow:2433166
12418 chr2 241666343 241666360 phastConsElements100way lod=175 score:505, srow:5221233
12418 chr2 241666365 241666365 phastConsElements100way lod=13 score:247, srow:5221234
12418 chr2 241666368 241666372 phastConsElements100way lod=25 score:312, srow:5221235
12418 chr2 241666413 241666415 phastConsElements100way lod=15 score:262, srow:5221236
12418 chr2 241666419 241666428 phastConsElements100way lod=36 score:348, srow:5221237
  • 6 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
12418 cellmeth_recounts PrEC: 16, LNCaP: 1, DU145: 0
12418 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=25, B=1, Length=380, Event=Down, log2FC=-4.64, padj=8.53718884068524e-06
12418 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=25, B=0, Length=400, Event=Down, log2FC=-Inf, padj=3.5894758062688e-07
12418 cellexp id=ENSG00000130294, name=KIF1A, PrEC=7, str=16, LNCaP=5688, str=4455, DU145=715, str=72
12418 tcgaexp gene=KIF1A, entrez=547, pos=chr2:241653181-241759725(-), B=3311, L=3723, M=3447, H=2561