DMR 1243 chr2:160902301-160902450 (150bp)

DMR Stats
Positionchr2:160902301-160902450 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesPLA2R1 (0bp away)
ANODEV p-value0.00377362684603
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 5.0 (83.33%), High: 3.0 (33.33 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
1243 PLA2R1 17193 uc002ube.2 chr2 160797260 160919126 - 150 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0) 0.0
1243 PLA2R1 17193 uc002ubf.3 chr2 160802326 160919126 - 150 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0) 0.0
1243 PLA2R1 17193 uc010zcp.2 chr2 160797260 160919126 - 150 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
1243 chr2 160902166 160902335 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 2 score:200, srow:661255
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
1243 cellmeth_recounts PrEC: 11, LNCaP: 0, DU145: 1
1243 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=17, B=0, Length=360, Event=Down, log2FC=-Inf, padj=5.95437566994235e-05
1243 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=17, B=1, Length=340, Event=Down, log2FC=-4.09, padj=0.00138789698671783
1243 cellexp id=ENSG00000153246, name=PLA2R1, PrEC=953, str=3144, LNCaP=5, str=3, DU145=396, str=344
1243 tcgaexp gene=PLA2R1, entrez=22925, pos=chr2:160797260-160919126(-), B=482, L=562, M=580, H=437