DMR 125 chr1:14098551-14098700 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:14098551-14098700 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesPRDM2 (0bp away)
ANODEV p-value0.00311972565436
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 0.0 (0.0%), High: 0.0 (0.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
125 PRDM2 265 uc001avg.3 chr1 14026735 14151574 + 150 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
125 PRDM2 265 uc001avh.3 chr1 14031350 14114574 + 150 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
125 PRDM2 265 uc001avi.3 chr1 14031350 14151574 + 150 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
125 PRDM2 265 uc001avk.3 chr1 14075856 14114574 + 150 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0) 0.0
125 PRDM2 265 uc009voe.3 chr1 14075856 14151574 + 150 100.0 0.05 1 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0) 0.0
125 PRDM2 265 uc009vof.3 chr1 14075856 14151574 + 150 100.0 0.04 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0) 0.0
125 PRDM2 265 uc021ogk.1 chr1 14075856 14107358 + 150 100.0 0.07 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0) 0.0
  • 7 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
125 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 0, DU145: 4
125 cellexp id=ENSG00000116731, name=PRDM2, PrEC=3050, str=4239, LNCaP=2463, str=2583, DU145=2002, str=2354
125 tcgaexp gene=PRDM2, entrez=7799, pos=chr1:14026735-14151574(+), B=3734, L=3334, M=3193, H=3190
125 tcgaexp gene=SRSF10, entrez=10772, pos=chr1:36273-24306953(-), B=3487, L=3388, M=3432, H=4019
125 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305