DMR 12565 chr3:31719251-31719400 (150bp)

DMR Stats
Positionchr3:31719251-31719400 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesOSBPL10 (0bp away)
ANODEV p-value0.000377559343929
FrequenciesBenign: 5.0 (71.43%), Low: 1.0 (16.67%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
12565 OSBPL10 19932 uc003ceu.1 chr3 31699403 31871723 - 150 100.0 1.62 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
12565 OSBPL10 19932 uc011axf.2 chr3 31702317 32023342 - 150 100.0 3.18 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
12565 OSBPL10 19932 uc021wuu.1 chr3 31702317 32023342 - 150 100.0 4.98 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (100), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
12565 chr3 31718806 31719315 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 8 score:258, srow:795713
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
12565 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 1, DU145: 5
12565 cellexp id=ENSG00000144645, name=OSBPL10, PrEC=5810, str=4791, LNCaP=119, str=287, DU145=2599, str=2989
12565 tcgaexp gene=OSBPL10, entrez=114884, pos=chr3:31699403-32023342(-), B=1776, L=1435, M=1448, H=1563