DMR 1261 chr2:168020901-168021050 (150bp)

DMR Stats
Positionchr2:168020901-168021050 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesXIRP2 (0bp away)
ANODEV p-value0.00645188968519
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 4.0 (66.67%), High: 1.0 (11.11 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
1261 XIRP2 17229 uc002udx.3 chr2 167744997 168116261 + 150 100.0 0.58 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
1261 XIRP2 17229 uc002udy.3 chr2 167992419 168108567 + 150 100.0 0.58 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0) 0.0
1261 XIRP2 17229 uc010fpn.3 chr2 167744997 168116261 + 150 100.0 0.08 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
1261 XIRP2 17229 uc010fpo.3 chr2 167744997 168116261 + 150 100.0 0.21 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
  • 4 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
1261 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 0, DU145: 3
1261 cellexp id=ENSG00000163092, name=XIRP2, PrEC=1, str=11, LNCaP=0, str=0, DU145=0, str=2
1261 tcgaexp gene=XIRP2, entrez=129446, pos=chr2:167744997-168116261(+), B=741, L=59, M=660, H=455