DMR 1265 chr2:169886051-169886350 (300bp)

DMR Stats
Positionchr2:169886051-169886350 (View on UCSC)
Width300bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesABCB11 (0bp away)
ANODEV p-value0.000523769119931
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 5.0 (83.33%), High: 1.0 (11.11 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
1265 ABCB11 17239 uc002ueo.1 chr2 169779449 169887833 - 300 100.0 1.75 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0) 0.0
  • 1 genes

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
1265 chr2 169885941 169886150 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 4 score:185, srow:664188
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
1265 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 0, DU145: 13
1265 cellexp id=ENSG00000073734, name=ABCB11, PrEC=7, str=9, LNCaP=55, str=58, DU145=0, str=0
1265 tcgaexp gene=ABCB11, entrez=8647, pos=chr2:169779449-169887833(-), B=2, L=2, M=3, H=7