DMR 1302 chr2:179787801-179787950 (150bp)

DMR Stats
Positionchr2:179787801-179787950 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesCCDC141 (0bp away)
ANODEV p-value0.00140023064428
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 5.0 (83.33%), High: 3.0 (33.33 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
1302 CCDC141 17338 uc002une.2 chr2 179694484 179914786 - 150 100.0 0.11 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0) 0.0
1302 CCDC141 17338 uc002ung.3 chr2 179737748 179914786 - 150 100.0 0.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
  • 2 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
1302 chr2 179787802 179787807 phastConsElements100way lod=19 score:285, srow:4993183
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
1302 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 0, DU145: 4
1302 cellexp id=ENSG00000163492, name=CCDC141, PrEC=2, str=0, LNCaP=34, str=268, DU145=1, str=0
1302 tcgaexp gene=CCDC141, entrez=285025, pos=chr2:179694484-179914786(-), B=82, L=26, M=113, H=121