DMR 13133 chr3:176871351-176871500 (150bp)

DMR Stats
Positionchr3:176871351-176871500 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesTBL1XR1 (0bp away)
ANODEV p-value0.0012187500585
FrequenciesBenign: 5.0 (71.43%), Low: 0.0 (0.0%), High: 7.0 (77.78 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
13133 TBL1XR1 21022 uc003fiw.4 chr3 176738542 176914266 - 150 100.0 3.7 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0) 0.0
13133 TBL1XR1 21022 uc003fix.4 chr3 176738542 176915048 - 150 100.0 1.89 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0) 0.0
13133 TBL1XR1 21022 uc003fiy.2 chr3 176769292 176915048 - 150 100.0 1.89 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0) 0.0
13133 TBL1XR1 21022 uc011bpz.2 chr3 176738542 176915048 - 150 100.0 2.18 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
  • 4 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
13133 cellmeth_recounts PrEC: 3, LNCaP: 5, DU145: 20
13133 cellexp id=ENSG00000177565, name=TBL1XR1, PrEC=8942, str=11916, LNCaP=25077, str=26922, DU145=7563, str=10143
13133 tcgaexp gene=TBL1XR1, entrez=79718, pos=chr3:176738542-176915048(-), B=8774, L=8982, M=10922, H=13614