DMR 14171 chr5:43125551-43125700 (150bp)

DMR Stats
Positionchr5:43125551-43125700 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Context3' end
Nearest GenesZNF131 (0bp away)
ANODEV p-value0.0346111595138
FrequenciesBenign: 6.0 (85.71%), Low: 2.0 (33.33%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
14171 ZNF131 22589 uc003jnj.4 chr5 43120985 43175823 + 150 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
14171 ZNF131 22589 uc003jnk.3 chr5 43121642 43175823 + 150 100.0 0.11 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
14171 ZNF131 22589 uc003jnl.1 chr5 43121642 43176346 + 150 100.0 0.05 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0) 0.0
14171 ZNF131 22589 uc003jnn.4 chr5 43121642 43175823 + 150 100.0 0.05 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0) 0.0
14171 ZNF131 22589 uc010ivl.1 chr5 43120985 43162033 + 150 100.0 0.08 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0) 0.0
14171 ZNF131 22589 uc010ivm.1 chr5 43121642 43192123 + 150 100.0 0.05 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
14171 ZNF131 22589 uc011cpw.2 chr5 43121610 43175823 + 150 100.0 0.05 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0) 0.0
  • 7 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
14171 chr5 43124006 43126005 cpgShelf — values(x.gr)[overs$srow, ]:31393
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
14171 cellmeth_recounts PrEC: 7, LNCaP: 3, DU145: 19
14171 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=4, B=42, Length=400, Event=Up, log2FC=3.39, padj=1.39916093410138e-07
14171 cellmeth_diffreps_LNCaPvsDU145 A=1.07, B=43.03, Length=440, Event=Up, log2FC=5.33, padj=3.68446846985264e-10
14171 cellmeth_diffreps_LNCaPvsDU145 A=7.48, B=32.74, Length=380, Event=Up, log2FC=2.13, padj=0.00405027397827298
14171 cellexp id=ENSG00000172262, name=ZNF131, PrEC=1855, str=2227, LNCaP=2024, str=2313, DU145=3773, str=5361
14171 tcgaexp gene=ZNF131, entrez=7690, pos=chr5:43120985-43192123(+), B=1108, L=1136, M=1169, H=1422