DMR 14843 chr6:35955851-35956050 (200bp)

DMR Stats
Positionchr6:35955851-35956050 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesSLC26A8 (0bp away)
ANODEV p-value0.000375227208905
FrequenciesBenign: 5.0 (71.43%), Low: 0.0 (0.0%), High: 7.0 (77.78 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
14843 SLC26A8 24474 uc003oll.3 chr6 35911291 35992277 - 200 100.0 0.11 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
14843 SLC26A8 24474 uc003olm.3 chr6 35911291 35992305 - 200 100.0 0.11 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0) 0.0
14843 SLC26A8 24474 uc003oln.3 chr6 35911291 35992413 - 200 100.0 0.08 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
14843 chr6 35955889 35956164 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 MAFF score:205, expCount:1, expNums:436, expScores:205, srow:3508909
14843 chr6 35955905 35956163 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 MAFK score:592, expCount:2, expNums:437,438, expScores:592,191, srow:3508910
  • 2 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
14843 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 5, DU145: 6
14843 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=2, B=20, Length=300, Event=Up, log2FC=3.32, padj=0.00147810318628949
14843 cellexp id=ENSG00000112053, name=SLC26A8, PrEC=7, str=7, LNCaP=2, str=0, DU145=3, str=2
14843 tcgaexp gene=SLC26A8, entrez=116369, pos=chr6:35911291-35992413(-), B=4, L=3, M=3, H=3