DMR 1557 chr3:11481751-11481900 (150bp)

DMR Stats
Positionchr3:11481751-11481900 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesATG7 (0bp away)
ANODEV p-value0.0349537703473
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 4.0 (66.67%), High: 2.0 (22.22 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
1557 ATG7 19808 uc003bwc.3 chr3 11314010 11599139 + 150 100.0 0.11 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (100), E19 (0) 0.0
1557 ATG7 19808 uc003bwd.3 chr3 11314010 11599139 + 150 100.0 0.08 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (100), E18 (0) 0.0
1557 ATG7 19808 uc011aum.2 chr3 11314010 11599139 + 150 100.0 0.08 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (100), E17 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
1557 chr3 11481546 11481795 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 2 score:148, srow:786446
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
1557 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 0, DU145: 4
1557 cellexp id=ENSG00000197548, name=ATG7, PrEC=2844, str=1736, LNCaP=1753, str=1245, DU145=1596, str=1301
1557 tcgaexp gene=ATG7, entrez=10533, pos=chr3:11314010-11599139(+), B=1707, L=1856, M=1862, H=1771