DMR 15657 chr7:70008351-70008500 (150bp)

DMR Stats
Positionchr7:70008351-70008500 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesAUTS2 (0bp away)
ANODEV p-value0.000549425903971
FrequenciesBenign: 6.0 (85.71%), Low: 0.0 (0.0%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
15657 AUTS2 27135 uc003tvw.4 chr7 69063905 70257885 + 150 100.0 0.18 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0) 0.0
15657 AUTS2 27135 uc003tvx.4 chr7 69063905 70257885 + 150 100.0 0.24 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
  • 2 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
15657 cellmeth_recounts PrEC: 2, LNCaP: 1, DU145: 0
15657 cellexp id=ENSG00000158321, name=AUTS2, PrEC=2367, str=2495, LNCaP=670, str=634, DU145=6, str=1
15657 tcgaexp gene=AUTS2, entrez=26053, pos=chr7:69063905-70257885(+), B=2268, L=1581, M=1728, H=1761