DMR 1609 chr3:33041151-33041350 (200bp)

DMR Stats
Positionchr3:33041151-33041350 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesGLB1 (0bp away)
ANODEV p-value0.0146009559146
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 4.0 (66.67%), High: 3.0 (33.33 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
1609 GLB1 19944 uc003cfh.1 chr3 33038100 33138314 - 200 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (100), E16 (0) 0.0
1609 GLB1 19944 uc003cfi.1 chr3 33038100 33138694 - 200 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (100), E16 (0) 0.0
1609 GLB1 19944 uc003cfj.1 chr3 33038100 33138694 - 200 100.0 0.23 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (100), E13 (0) 0.0
1609 GLB1 19944 uc011axk.1 chr3 33038100 33138694 - 200 100.0 0.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (100), E17 (0) 0.0
  • 4 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
1609 cellmeth_recounts PrEC: 2, LNCaP: 1, DU145: 4
1609 cellexp id=ENSG00000170266, name=GLB1, PrEC=5715, str=16082, LNCaP=3666, str=3286, DU145=3153, str=3602
1609 tcgaexp gene=GLB1, entrez=2720, pos=chr3:33038100-33138694(-), B=3647, L=4475, M=4382, H=3817