DMR 161 chr1:24428901-24429050 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:24428901-24429050 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesMYOM3 (0bp away)
ANODEV p-value0.0167110515977
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 0.0 (0.0%), High: 0.0 (0.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
161 MYOM3 440 uc001bin.4 chr1 24382531 24438665 - 150 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0), I36 (0), E37 (0) 0.0
161 MYOM3 440 uc001bio.3 chr1 24392137 24438665 - 150 100.0 0.12 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0) 0.0
161 MYOM3 440 uc001bip.1 chr1 24408039 24434929 - 150 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
161 chr1 24428821 24428990 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 8 score:1000, srow:19571
161 chr1 24428610 24429019 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 GATA2 score:452, expCount:2, expNums:498,586, expScores:126,452, srow:65388
161 chr1 24428900 24428905 phastConsElements100way lod=14 score:255, srow:97289
161 chr1 24428908 24428913 phastConsElements100way lod=14 score:255, srow:97290
161 chr1 24428961 24428965 phastConsElements100way lod=17 score:274, srow:97291
  • 5 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
161 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 1, DU145: 1
161 cellexp id=ENSG00000142661, name=MYOM3, PrEC=34, str=521, LNCaP=1, str=1, DU145=3, str=2
161 tcgaexp gene=MYOM3, entrez=127294, pos=chr1:24382531-24438665(-), B=273, L=54, M=253, H=148
161 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305