DMR 1674 chr3:55723651-55723900 (250bp)

DMR Stats
Positionchr3:55723651-55723900 (View on UCSC)
Width250bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesERC2 (0bp away)
ANODEV p-value0.000270732578111
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 5.0 (83.33%), High: 2.0 (22.22 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
1674 ERC2 20282 uc003dhq.1 chr3 55542336 55984588 - 250 100.0 0.05 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0) 0.0
1674 ERC2 20282 uc003dhr.1 chr3 55542336 56502391 - 250 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (100), E16 (0), I16 (0), E17 (0) 0.0
1674 ERC2 20282 uc021wzo.1 chr3 55717822 56469175 - 250 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (100), E16 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
1674 chr3 55723705 55723713 phastConsElements100way lod=13 score:247, srow:5853488
1674 chr3 55723857 55723866 phastConsElements100way lod=13 score:247, srow:5853489
  • 2 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
1674 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 4, DU145: 14
1674 cellexp id=ENSG00000187672, name=ERC2, PrEC=24, str=28, LNCaP=28, str=26, DU145=35, str=11
1674 tcgaexp gene=ERC2, entrez=26059, pos=chr3:55542336-56502391(-), B=87, L=64, M=58, H=51