DMR 17729 chr10:35652251-35652450 (200bp)

DMR Stats
Positionchr10:35652251-35652450 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesCCNY (0bp away)
ANODEV p-value0.00455075638238
FrequenciesBenign: 5.0 (71.43%), Low: 0.0 (0.0%), High: 7.0 (77.78 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
17729 CCNY 3129 uc001iyu.4 chr10 35535953 35860847 + 200 100.0 0.21 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
17729 CCNY 3129 uc001iyv.4 chr10 35539450 35860847 + 200 100.0 0.21 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
17729 CCNY 3129 uc001iyw.4 chr10 35625802 35860847 + 200 100.0 0.16 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
17729 CCNY 3129 uc001iyx.4 chr10 35625802 35860847 + 200 100.0 0.16 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
17729 CCNY 3129 uc009xmb.3 chr10 35625802 35860847 + 200 100.0 0.16 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
17729 CCNY 3129 uc010qet.2 chr10 35625802 35860847 + 200 100.0 0.16 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
  • 6 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
17729 chr10 35651841 35652255 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 4 score:117, srow:137650
17729 chr10 35652266 35652535 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 2 score:139, srow:137651
  • 2 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
17729 cellmeth_recounts PrEC: 11, LNCaP: 3, DU145: 10
17729 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=198, B=18, Length=860, Event=Down, log2FC=-3.46, padj=0
17729 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=193, B=34, Length=660, Event=Down, log2FC=-2.5, padj=0
17729 cellexp id=ENSG00000108100, name=CCNY, PrEC=5325, str=2973, LNCaP=4929, str=4847, DU145=3358, str=3450
17729 tcgaexp gene=DUX4, entrez=22947, pos=chr10:76142-191000255(+), B=0, L=0, M=0, H=0
17729 tcgaexp gene=CCNY, entrez=219771, pos=chr10:35535953-35860847(+), B=4415, L=4445, M=4655, H=4608