DMR 17878 chr10:75551801-75552000 (200bp)

DMR Stats
Positionchr10:75551801-75552000 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextpromoter
Nearest GenesZSWIM8 (0bp away)
ANODEV p-value0.00474155627591
FrequenciesBenign: 6.0 (85.71%), Low: 2.0 (33.33%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
17878 ZSWIM8 3433 uc001jve.3 chr10 75545382 75561556 + 200 100.0 1.74 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (100), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0) 0.0
17878 ZSWIM8 3433 uc001jvf.3 chr10 75545382 75561556 + 200 100.0 1.74 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (100), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0) 0.0
17878 ZSWIM8 3433 uc001jvh.3 chr10 75551082 75561556 + 200 100.0 17.87 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (100), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
17878 ZSWIM8 3433 uc001jvi.3 chr10 75551617 75561556 + 200 100.0 0.46 0 100.0 E1 (100), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0) 0.0
17878 ZSWIM8 3433 uc001jvj.3 chr10 75545382 75561556 + 200 100.0 0.45 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (100), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0) 0.0
17878 ZSWIM8 3433 uc009xrl.3 chr10 75545382 75561556 + 200 100.0 1.0 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (100), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0) 0.0
17878 ZSWIM8 3433 uc010qkr.2 chr10 75551617 75561556 + 200 100.0 1.0 0 100.0 E1 (100), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0) 0.0
  • 7 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
17878 chr10 75551941 75552095 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 2 score:204, srow:151884
17878 chr10 75551821 75551849 tfbsConsSites V$MYOGNF1_01 score:755, zScore:2.01, srow:612949
17878 chr10 75551903 75551913 tfbsConsSites V$AP1_Q4 score:894, zScore:1.64, srow:612950
17878 chr10 75551908 75551917 tfbsConsSites V$AP4_Q6 score:996, zScore:2.5, srow:612951
17878 chr10 75551909 75551936 tfbsConsSites V$PAX5_02 score:770, zScore:1.8, srow:612952
17878 chr10 75551920 75551936 tfbsConsSites V$LUN1_01 score:781, zScore:3.02, srow:612953
17878 chr10 75551953 75551965 tfbsConsSites V$MZF1_02 score:920, zScore:2.8, srow:612954
17878 chr10 75551973 75551982 tfbsConsSites V$AP4_Q6 score:962, zScore:2.02, srow:612955
17878 chr10 75551804 75551804 cosmic COSM1735389 srow:153444
17878 chr10 75551804 75551804 cosmic COSM1735388 srow:153445
17878 chr10 75551933 75551933 cosmic COSM1603724 srow:153446
17878 chr10 75551933 75551933 cosmic COSM1603723 srow:153447
17878 chr10 75551975 75551975 cosmic COSM465958 srow:153448
17878 chr10 75551975 75551975 cosmic COSM465957 srow:153449
17878 chr10 75551984 75551984 cosmic COSM685342 srow:153450
17878 chr10 75551984 75551984 cosmic COSM685341 srow:153451
17878 chr10 75551989 75551989 cosmic COSM920401 srow:153452
17878 chr10 75551989 75551989 cosmic COSM920400 srow:153453
17878 chr10 75551798 75551811 phastConsElements100way lod=132 score:477, srow:1085506
17878 chr10 75551813 75551835 phastConsElements100way lod=257 score:543, srow:1085507
17878 chr10 75551840 75551841 phastConsElements100way lod=20 score:290, srow:1085508
17878 chr10 75551846 75551849 phastConsElements100way lod=26 score:316, srow:1085509
17878 chr10 75551861 75551883 phastConsElements100way lod=150 score:489, srow:1085510
17878 chr10 75551886 75551887 phastConsElements100way lod=13 score:247, srow:1085511
17878 chr10 75551891 75551892 phastConsElements100way lod=14 score:255, srow:1085512
  • Page 1 of 2
  • 25 of 35 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
17878 cellmeth_recounts PrEC: 19, LNCaP: 3, DU145: 5
17878 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=136, B=12, Length=620, Event=Down, log2FC=-3.5, padj=0
17878 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=136, B=7, Length=620, Event=Down, log2FC=-4.28, padj=0
17878 cellexp id=ENSG00000214655, name=ZSWIM8, PrEC=2661, str=3711, LNCaP=3059, str=1742, DU145=2130, str=1583
17878 tcgaexp gene=DUX4, entrez=22947, pos=chr10:76142-191000255(+), B=0, L=0, M=0, H=0
17878 tcgaexp gene=ZSWIM8, entrez=23053, pos=chr10:75545382-75561556(+), B=5819, L=5422, M=5201, H=5662