DMR 18194 chr10:134166651-134166800 (150bp)

DMR Stats
Positionchr10:134166651-134166800 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Context3' end
Nearest GenesLRRC27 (0bp away)
ANODEV p-value0.00454822273846
FrequenciesBenign: 7.0 (100.0%), Low: 2.0 (33.33%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
18194 LRRC27 4032 uc001llf.2 chr10 134145614 134166901 + 150 100.0 1.2 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (100) 100.0
18194 LRRC27 4032 uc001llg.2 chr10 134145614 134195010 + 150 100.0 0.46 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
18194 LRRC27 4032 uc001lli.2 chr10 134145741 134195010 + 150 100.0 0.61 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
18194 LRRC27 4032 uc001llj.2 chr10 134148612 134195010 + 150 100.0 0.46 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
18194 LRRC27 4032 uc001llk.4 chr10 134150611 134180509 + 150 100.0 0.61 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
18194 LRRC27 4032 uc010quv.1 chr10 134145614 134166901 + 150 100.0 3.92 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (100) 100.0
18194 LRRC27 4032 uc010quw.1 chr10 134145614 134195010 + 150 100.0 0.41 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
  • 7 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
18194 chr10 134166426 134166675 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 11 score:304, srow:183213
18194 chr10 134166766 134167310 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 7 score:225, srow:183214
18194 chr10 134166509 134166770 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 CTCF score:160, expCount:4, expNums:597,603,607,644, expScores:123,160,118,115, srow:635311
18194 chr10 134165477 134166781 oreganno OREG0020637 id:OREG0020637, srow:3512
18194 chr10 134166314 134168313 cpgShore — values(x.gr)[overs$srow, ]:6432
  • 5 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
18194 cellmeth_recounts PrEC: 8, LNCaP: 6, DU145: 0
18194 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=12, B=0, Length=280, Event=Down, log2FC=-Inf, padj=0.00174045876043459
18194 cellexp id=ENSG00000148814, name=LRRC27, PrEC=213, str=363, LNCaP=908, str=575, DU145=211, str=131
18194 tcgameth site:cg18219997, B=0.85, L=0.87, H=0.84
18194 tcgaexp gene=DUX4, entrez=22947, pos=chr10:76142-191000255(+), B=0, L=0, M=0, H=0
18194 tcgaexp gene=LRRC27, entrez=80313, pos=chr10:134145614-134195010(+), B=581, L=573, M=606, H=563