DMR 18243 chr11:663251-663450 (200bp)

DMR Stats
Positionchr11:663251-663450 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesDEAF1 (0bp away)
ANODEV p-value0.00330599031155
FrequenciesBenign: 5.0 (71.43%), Low: 0.0 (0.0%), High: 7.0 (77.78 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
18243 DEAF1 4100 uc001lqq.1 chr11 644225 695740 - 200 100.0 0.35 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (100), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
18243 DEAF1 4100 uc009ycf.1 chr11 644225 688057 - 200 100.0 0.35 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
18243 DEAF1 4100 uc021qbn.1 chr11 644225 695740 - 200 100.0 0.35 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (100), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
18243 chr11 662682 664681 cpgShelf — values(x.gr)[overs$srow, ]:5844
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
18243 cellmeth_recounts PrEC: 13, LNCaP: 9, DU145: 8
18243 cellexp id=ENSG00000177030, name=DEAF1, PrEC=1426, str=914, LNCaP=5012, str=2939, DU145=1729, str=2236
18243 tcgaexp gene=DEAF1, entrez=10522, pos=chr11:644225-695740(-), B=2273, L=3287, M=3464, H=2795