DMR 1832 chr3:121241051-121241250 (200bp)

DMR Stats
Positionchr3:121241051-121241250 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesPOLQ (0bp away)
ANODEV p-value0.00372982159852
FrequenciesBenign: 1.0 (14.29%), Low: 5.0 (83.33%), High: 1.0 (11.11 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
1832 POLQ 20597 uc003eee.4 chr3 121150273 121264853 - 200 100.0 0.29 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0) 0.0
  • 1 genes

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
1832 chr3 121241055 121241063 phastConsElements100way lod=15 score:262, srow:6081894
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
1832 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 0, DU145: 10
1832 cellexp id=ENSG00000051341, name=POLQ, PrEC=1951, str=162, LNCaP=936, str=2321, DU145=1635, str=2262
1832 tcgaexp gene=POLQ, entrez=10721, pos=chr3:121150273-121264853(-), B=29, L=29, M=40, H=125