DMR 1834 chr3:121375951-121376100 (150bp)

DMR Stats
Positionchr3:121375951-121376100 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesHCLS1 (0bp away)
ANODEV p-value0.0159744915568
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 4.0 (66.67%), High: 3.0 (33.33 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
1834 HCLS1 20600 uc003eeh.4 chr3 121350246 121379791 - 150 100.0 0.33 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
1834 HCLS1 20600 uc011bjj.2 chr3 121350246 121379791 - 150 100.0 0.12 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
1834 HCLS1 20600 uc011bjk.1 chr3 121351179 121379791 - 150 100.0 0.33 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
1834 HCLS1 20600 uc011bjl.1 chr3 121362968 121379791 - 150 100.0 0.05 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0) 0.0
  • 4 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
1834 cellmeth_recounts PrEC: 2, LNCaP: 0, DU145: 0
1834 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=15, B=0, Length=360, Event=Down, log2FC=-Inf, padj=0.000225236251108575
1834 cellexp id=ENSG00000180353, name=HCLS1, PrEC=423, str=805, LNCaP=19, str=33, DU145=7, str=1
1834 tcgaexp gene=HCLS1, entrez=3059, pos=chr3:121350246-121379791(-), B=1018, L=932, M=947, H=1116