DMR 18745 chr11:70406901-70407100 (200bp)

DMR Stats
Positionchr11:70406901-70407100 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesSHANK2, BC127192 (0bp away)
ANODEV p-value0.00135412398509
FrequenciesBenign: 6.0 (85.71%), Low: 0.0 (0.0%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
18745 SHANK2 5263 uc001opz.3 chr11 70313961 70507923 - 200 100.0 0.16 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
18745 SHANK2 5263 uc001oqc.3 chr11 70313961 70935842 - 200 100.0 0.1 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (100), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0) 0.0
18745 BC127192 5264 uc009ysn.1 chr11 70318924 70507872 + 200 100.0 0.16 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0) 0.0
18745 SHANK2 5263 uc010rqn.2 chr11 70313961 70507923 - 200 100.0 0.12 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
18745 SHANK2 5263 uc010rqp.1 chr11 70336271 70507923 - 200 100.0 0.12 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0) 0.0
  • 5 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
18745 cellmeth_recounts PrEC: 3, LNCaP: 9, DU145: 22
18745 cellexp id=ENSG00000162105, name=SHANK2, PrEC=1064, str=2152, LNCaP=1643, str=1183, DU145=1896, str=1777
18745 tcgaexp gene=SHANK2, entrez=22941, pos=chr11:70313961-70935842(-), B=1621, L=2517, M=2515, H=2277