DMR 1931 chr3:169225401-169225550 (150bp)

DMR Stats
Positionchr3:169225401-169225550 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesMECOM (0bp away)
ANODEV p-value5.07114132674e-05
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 5.0 (83.33%), High: 1.0 (11.11 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
1931 MECOM 20975 uc010hwn.2 chr3 168819848 169381563 - 150 100.0 0.49 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
1931 MECOM 20975 uc011bpj.1 chr3 168801287 169381563 - 150 100.0 0.49 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0) 0.0
1931 MECOM 20975 uc011bpk.1 chr3 168801287 169381563 - 150 100.0 0.34 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0) 0.0
1931 MECOM 20975 uc011bpl.1 chr3 168867391 169381563 - 150 100.0 0.34 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0) 0.0
  • 4 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
1931 chr3 169225418 169225426 phastConsElements100way lod=17 score:274, srow:6243999
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
1931 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 0, DU145: 10
1931 cellexp id=ENSG00000085276, name=MECOM, PrEC=2002, str=1306, LNCaP=58, str=105, DU145=767, str=652
1931 tcgaexp gene=MECOM, entrez=2122, pos=chr3:168801287-169381563(-), B=1717, L=565, M=700, H=748