DMR 1948 chr3:175110951-175111200 (250bp)

DMR Stats
Positionchr3:175110951-175111200 (View on UCSC)
Width250bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesNAALADL2 (0bp away)
ANODEV p-value0.00933372642057
FrequenciesBenign: 1.0 (14.29%), Low: 5.0 (83.33%), High: 2.0 (22.22 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
1948 NAALADL2 21018 uc003fit.3 chr3 174577111 175523428 + 250 100.0 0.13 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
1948 NAALADL2 21018 uc003fiu.1 chr3 174581616 175299009 + 250 100.0 0.17 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
1948 NAALADL2 21018 uc010hwy.2 chr3 174842196 175373351 + 250 100.0 0.13 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
1948 NAALADL2 21018 uc010hwz.1 chr3 174974200 175205437 + 250 100.0 0.1 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0) 0.0
  • 4 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
1948 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 0, DU145: 5
1948 cellexp id=ENSG00000177694, name=NAALADL2, PrEC=41, str=386, LNCaP=4158, str=3969, DU145=71, str=38
1948 tcgaexp gene=NAALADL2, entrez=254827, pos=chr3:174577111-175523428(+), B=1043, L=1787, M=2263, H=3127