DMR 1975 chr3:185098201-185098400 (200bp)

DMR Stats
Positionchr3:185098201-185098400 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesMAP3K13 (0bp away)
ANODEV p-value0.000549294653782
FrequenciesBenign: 1.0 (14.29%), Low: 6.0 (100.0%), High: 3.0 (33.33 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
1975 MAP3K13 21100 uc003fph.4 chr3 185046683 185169322 + 200 100.0 1.7 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0) 0.0
1975 MAP3K13 21100 uc003fpi.3 chr3 185080836 185206882 + 200 100.0 0.08 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
1975 MAP3K13 21100 uc010hyf.3 chr3 185000729 185206882 + 200 100.0 0.28 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
1975 MAP3K13 21100 uc010hyg.3 chr3 185080836 185206882 + 200 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
1975 MAP3K13 21100 uc011brt.2 chr3 185000729 185206882 + 200 100.0 0.02 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
1975 MAP3K13 21100 uc011bru.2 chr3 185046683 185206882 + 200 100.0 0.02 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
  • 6 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
1975 chr3 185098286 185098455 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 2 score:210, srow:856724
1975 chr3 185098271 185098546 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 MAFF score:170, expCount:1, expNums:436, expScores:170, srow:2958055
1975 chr3 185098285 185098554 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 MAFK score:519, expCount:3, expNums:437,438,464, expScores:519,272,251, srow:2958056
  • 3 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
1975 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 9, DU145: 14
1975 cellexp id=ENSG00000073803, name=MAP3K13, PrEC=1661, str=1562, LNCaP=3359, str=3311, DU145=1830, str=1761
1975 tcgaexp gene=MAP3K13, entrez=9175, pos=chr3:185000729-185206882(+), B=110, L=160, M=147, H=171