DMR 2010 chr3:194312901-194313300 (400bp)

DMR Stats
Positionchr3:194312901-194313300 (View on UCSC)
Width400bp
Genomic Context3' end
Nearest GenesTMEM44 (0bp away)
ANODEV p-value0.0067444800938
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 4.0 (66.67%), High: 1.0 (11.11 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
2010 TMEM44 21180 uc003fuc.3 chr3 194308402 194338374 - 400 100.0 0.02 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0) 0.0
2010 TMEM44 21180 uc003fue.3 chr3 194308402 194354150 - 400 100.0 0.02 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (100), E10 (0) 0.0
2010 TMEM44 21180 uc003fuf.3 chr3 194308402 194354150 - 400 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (100), E10 (0) 0.0
2010 TMEM44 21180 uc010hzm.3 chr3 194308402 194336426 - 400 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0) 0.0
2010 TMEM44 21180 uc010hzn.3 chr3 194308402 194354150 - 400 100.0 0.07 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (100), E11 (0) 0.0
2010 TMEM44 21180 uc011bsv.2 chr3 194308402 194354150 - 400 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (100), E11 (0) 0.0
2010 TMEM44 21180 uc021xjc.1 chr3 194308402 194337998 - 400 100.0 0.05 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0) 0.0
  • 7 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
2010 chr3 194313042 194313045 phastConsElements100way lod=16 score:268, srow:6338884
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
2010 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 0, DU145: 0
2010 cellexp id=ENSG00000145014, name=TMEM44, PrEC=983, str=3153, LNCaP=316, str=140, DU145=841, str=542
2010 tcgaexp gene=TMEM44, entrez=93109, pos=chr3:194308402-194354418(-), B=391, L=489, M=483, H=439