DMR 20106 chr14:64675101-64675250 (150bp)

DMR Stats
Positionchr14:64675101-64675250 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextpromoter
Nearest GenesSYNE2 (0bp away)
ANODEV p-value0.00224279721182
FrequenciesBenign: 5.0 (71.43%), Low: 2.0 (33.33%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
20106 SYNE2 8332 uc001xgl.3 chr14 64319683 64693167 + 150 100.0 0.07 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0), I36 (0), E37 (0), I37 (0), E38 (0), I38 (0), E39 (0), I39 (0), E40 (0), I40 (0), E41 (0), I41 (0), E42 (0), I42 (0), E43 (0), I43 (0), E44 (0), I44 (0), E45 (0), I45 (0), E46 (0), I46 (0), E47 (0), I47 (0), E48 (0), I48 (0), E49 (0), I49 (0), E50 (0), I50 (0), E51 (0), I51 (0), E52 (0), I52 (0), E53 (0), I53 (0), E54 (0), I54 (0), E55 (0), I55 (0), E56 (0), I56 (0), E57 (0), I57 (0), E58 (0), I58 (0), E59 (0), I59 (0), E60 (0), I60 (0), E61 (0), I61 (0), E62 (0), I62 (0), E63 (0), I63 (0), E64 (0), I64 (0), E65 (0), I65 (0), E66 (0), I66 (0), E67 (0), I67 (0), E68 (0), I68 (0), E69 (0), I69 (0), E70 (0), I70 (0), E71 (0), I71 (0), E72 (0), I72 (0), E73 (0), I73 (0), E74 (0), I74 (0), E75 (0), I75 (0), E76 (0), I76 (0), E77 (0), I77 (0), E78 (0), I78 (0), E79 (0), I79 (0), E80 (0), I80 (0), E81 (0), I81 (0), E82 (0), I82 (0), E83 (0), I83 (0), E84 (0), I84 (0), E85 (0), I85 (0), E86 (0), I86 (0), E87 (0), I87 (0), E88 (0), I88 (0), E89 (0), I89 (0), E90 (0), I90 (0), E91 (0), I91 (0), E92 (0), I92 (0), E93 (0), I93 (0), E94 (0), I94 (0), E95 (0), I95 (0), E96 (0), I96 (0), E97 (0), I97 (0), E98 (0), I98 (0), E99 (0), I99 (0), E100 (0), I100 (100), E101 (0), I101 (0), E102 (0), I102 (0), E103 (0), I103 (0), E104 (0), I104 (0), E105 (0), I105 (0), E106 (0), I106 (0), E107 (0), I107 (0), E108 (0), I108 (0), E109 (0), I109 (0), E110 (0), I110 (0), E111 (0), I111 (0), E112 (0), I112 (0), E113 (0), I113 (0), E114 (0), I114 (0), E115 (0), I115 (0), E116 (0) 0.0
20106 SYNE2 8332 uc001xgm.3 chr14 64319683 64693167 + 150 100.0 0.07 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0), I36 (0), E37 (0), I37 (0), E38 (0), I38 (0), E39 (0), I39 (0), E40 (0), I40 (0), E41 (0), I41 (0), E42 (0), I42 (0), E43 (0), I43 (0), E44 (0), I44 (0), E45 (0), I45 (0), E46 (0), I46 (0), E47 (0), I47 (0), E48 (0), I48 (0), E49 (0), I49 (0), E50 (0), I50 (0), E51 (0), I51 (0), E52 (0), I52 (0), E53 (0), I53 (0), E54 (0), I54 (0), E55 (0), I55 (0), E56 (0), I56 (0), E57 (0), I57 (0), E58 (0), I58 (0), E59 (0), I59 (0), E60 (0), I60 (0), E61 (0), I61 (0), E62 (0), I62 (0), E63 (0), I63 (0), E64 (0), I64 (0), E65 (0), I65 (0), E66 (0), I66 (0), E67 (0), I67 (0), E68 (0), I68 (0), E69 (0), I69 (0), E70 (0), I70 (0), E71 (0), I71 (0), E72 (0), I72 (0), E73 (0), I73 (0), E74 (0), I74 (0), E75 (0), I75 (0), E76 (0), I76 (0), E77 (0), I77 (0), E78 (0), I78 (0), E79 (0), I79 (0), E80 (0), I80 (0), E81 (0), I81 (0), E82 (0), I82 (0), E83 (0), I83 (0), E84 (0), I84 (0), E85 (0), I85 (0), E86 (0), I86 (0), E87 (0), I87 (0), E88 (0), I88 (0), E89 (0), I89 (0), E90 (0), I90 (0), E91 (0), I91 (0), E92 (0), I92 (0), E93 (0), I93 (0), E94 (0), I94 (0), E95 (0), I95 (0), E96 (0), I96 (0), E97 (0), I97 (0), E98 (0), I98 (0), E99 (0), I99 (0), E100 (0), I100 (100), E101 (0), I101 (0), E102 (0), I102 (0), E103 (0), I103 (0), E104 (0), I104 (0), E105 (0), I105 (0), E106 (0), I106 (0), E107 (0), I107 (0), E108 (0), I108 (0), E109 (0), I109 (0), E110 (0), I110 (0), E111 (0), I111 (0), E112 (0), I112 (0), E113 (0), I113 (0), E114 (0), I114 (0), E115 (0) 0.0
20106 SYNE2 8332 uc001xgn.3 chr14 64606659 64693167 + 150 100.0 0.07 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (100), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0) 0.0
20106 SYNE2 8332 uc001xgo.3 chr14 64608059 64693167 + 150 100.0 0.07 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (100), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0) 0.0
20106 SYNE2 8332 uc001xgq.3 chr14 64634213 64693167 + 150 100.0 0.07 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (100), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0) 0.0
20106 SYNE2 8332 uc010apy.3 chr14 64542333 64693167 + 150 100.0 0.07 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0), I36 (0), E37 (0), I37 (0), E38 (0), I38 (0), E39 (0), I39 (0), E40 (0), I40 (0), E41 (0), I41 (0), E42 (0), I42 (0), E43 (0), I43 (0), E44 (0), I44 (0), E45 (0), I45 (0), E46 (0), I46 (0), E47 (0), I47 (0), E48 (0), I48 (100), E49 (0), I49 (0), E50 (0), I50 (0), E51 (0), I51 (0), E52 (0), I52 (0), E53 (0), I53 (0), E54 (0), I54 (0), E55 (0), I55 (0), E56 (0), I56 (0), E57 (0), I57 (0), E58 (0), I58 (0), E59 (0), I59 (0), E60 (0), I60 (0), E61 (0), I61 (0), E62 (0), I62 (0), E63 (0) 0.0
20106 SYNE2 8332 uc010aqa.3 chr14 64628790 64693167 + 150 100.0 0.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (100), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0) 0.0
20106 SYNE2 8332 uc021rui.1 chr14 64606659 64693167 + 150 100.0 0.07 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (100), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0), I36 (0), E37 (0), I37 (0), E38 (0) 0.0
  • 8 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
20106 chr14 64675086 64675235 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 2 score:271, srow:359006
20106 chr14 64675037 64675379 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 CTCF score:463, expCount:18, expNums:0,5,137,174,595,598,603,604,605,606,609,627,628,629,630,631,635,688, expScores:176,383,201,123,435,199,222,289,267,114,324,225,463,270,383,290,215,224, srow:1227675
20106 chr14 64675064 64675307 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 RAD21 score:581, expCount:2, expNums:149,355, expScores:581,330, srow:1227676
20106 chr14 64675183 64675198 tfbsConsSites V$TAL1ALPHAE47_01 score:894, zScore:2.21, srow:1576920
20106 chr14 64675183 64675198 tfbsConsSites V$TAL1BETAITF2_01 score:882, zScore:2.31, srow:1576921
20106 chr14 64675186 64675195 tfbsConsSites V$MYOD_Q6 score:964, zScore:1.77, srow:1576922
20106 chr14 64675188 64675199 tfbsConsSites V$MEIS1_01 score:932, zScore:2.26, srow:1576923
  • 7 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
20106 cellmeth_recounts PrEC: 12, LNCaP: 1, DU145: 0
20106 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=123, B=4, Length=740, Event=Down, log2FC=-4.94, padj=0
20106 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=123, B=5, Length=740, Event=Down, log2FC=-4.62, padj=0
20106 cellexp id=ENSG00000054654, name=SYNE2, PrEC=3731, str=3498, LNCaP=4298, str=4701, DU145=6376, str=6679
20106 cellexp id=ENSG00000140009, name=ESR2, PrEC=15, str=27, LNCaP=11, str=16, DU145=14, str=11
20106 tcgaexp gene=SYNE2, entrez=23224, pos=chr14:64319683-64693167(+), B=6239, L=6054, M=5989, H=5569