DMR 20935 chr16:144951-145100 (150bp)

DMR Stats
Positionchr16:144951-145100 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesNPRL3 (0bp away)
ANODEV p-value0.0166850191133
FrequenciesBenign: 2.0 (28.57%), Low: 0.0 (0.0%), High: 4.0 (44.44 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
20935 NPRL3 10657 uc002cfp.2 chr16 134273 188697 - 150 100.0 0.28 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (100), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
20935 NPRL3 10657 uc002cfq.3 chr16 135804 188697 - 150 100.0 0.21 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
20935 NPRL3 10657 uc002cfr.3 chr16 135804 188697 - 150 100.0 0.28 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (100), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
20935 NPRL3 10657 uc010uua.1 chr16 134273 188333 - 150 100.0 0.21 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
20935 NPRL3 10657 uc021szl.1 chr16 135804 188697 - 150 100.0 0.21 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (100), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0) 0.0
20935 NPRL3 10657 uc021szm.1 chr16 135804 188697 - 150 100.0 0.43 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (100), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
20935 NPRL3 10657 uc021szn.1 chr16 135804 188697 - 150 100.0 0.21 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
  • 7 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
20935 cellmeth_recounts PrEC: 7, LNCaP: 3, DU145: 0
20935 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=43, B=1, Length=620, Event=Down, log2FC=-5.43, padj=9.58374424500004e-11
20935 cellexp id=ENSG00000103148, name=NPRL3, PrEC=4044, str=1619, LNCaP=6038, str=4481, DU145=2617, str=1896
20935 tcgaexp gene=NPRL3, entrez=8131, pos=chr16:134273-188697(-), B=1843, L=2423, M=2521, H=2379