DMR 21139 chr16:16251501-16251650 (150bp)

DMR Stats
Positionchr16:16251501-16251650 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextexon
Nearest GenesABCC6 (0bp away)
ANODEV p-value0.00692896209993
FrequenciesBenign: 5.0 (71.43%), Low: 2.0 (33.33%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
21139 ABCC6 11002 uc002den.4 chr16 16243422 16317328 - 150 100.0 2.05 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (87.33), I27 (12.67), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0) 0.0
21139 ABCC6 11002 uc010bvo.3 chr16 16243422 16317328 - 150 100.0 2.05 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (87.33), I25 (12.67), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0) 0.0
  • 2 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
21139 chr16 16251592 16251606 tfbsConsSites V$STAT5A_01 score:875, zScore:2, srow:1904084
21139 chr16 16251592 16251606 tfbsConsSites V$STAT5B_01 score:847, zScore:1.81, srow:1904085
21139 chr16 16251588 16251588 cosmic COSM228639 srow:430175
21139 chr16 16251615 16251615 cosmic COSM181762 srow:430176
21139 chr16 16251518 16251525 phastConsElements100way lod=110 score:459, srow:3275707
21139 chr16 16251536 16251537 phastConsElements100way lod=22 score:300, srow:3275708
21139 chr16 16251546 16251548 phastConsElements100way lod=23 score:304, srow:3275709
21139 chr16 16251557 16251558 phastConsElements100way lod=19 score:285, srow:3275710
21139 chr16 16251560 16251563 phastConsElements100way lod=23 score:304, srow:3275711
21139 chr16 16251566 16251569 phastConsElements100way lod=33 score:340, srow:3275712
21139 chr16 16251575 16251576 phastConsElements100way lod=16 score:268, srow:3275713
21139 chr16 16251580 16251582 phastConsElements100way lod=38 score:354, srow:3275714
21139 chr16 16251584 16251585 phastConsElements100way lod=13 score:247, srow:3275715
21139 chr16 16251587 16251587 phastConsElements100way lod=15 score:262, srow:3275716
21139 chr16 16251593 16251595 phastConsElements100way lod=24 score:308, srow:3275717
21139 chr16 16251600 16251603 phastConsElements100way lod=33 score:340, srow:3275718
21139 chr16 16251608 16251608 phastConsElements100way lod=17 score:274, srow:3275719
21139 chr16 16251614 16251615 phastConsElements100way lod=27 score:320, srow:3275720
21139 chr16 16251623 16251630 phastConsElements100way lod=91 score:440, srow:3275721
  • 19 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
21139 cellmeth_recounts PrEC: 9, LNCaP: 0, DU145: 0
21139 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=13, B=0, Length=340, Event=Down, log2FC=-Inf, padj=0.000827318446465587
21139 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=13, B=0, Length=340, Event=Down, log2FC=-Inf, padj=0.000941091010072773
21139 cellexp id=ENSG00000091262, name=ABCC6, PrEC=25, str=176, LNCaP=184, str=152, DU145=142, str=81
21139 tcgaexp gene=ABCC6, entrez=368, pos=chr16:16243422-16317328(-), B=335, L=134, M=179, H=136