DMR 22711 chr19:1805801-1805950 (150bp)

DMR Stats
Positionchr19:1805801-1805950 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextpromoter
Nearest GenesATP8B3 (0bp away)
ANODEV p-value0.000123993292465
FrequenciesBenign: 6.0 (85.71%), Low: 1.0 (16.67%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
22711 ATP8B3 14166 uc002ltv.4 chr19 1782074 1812236 - 150 100.0 2.24 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (42.67), I9 (57.33), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0) 0.0
22711 ATP8B3 14166 uc002ltw.4 chr19 1782074 1812275 - 150 100.0 0.25 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (42.67), I9 (57.33), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0) 0.0
22711 ATP8B3 14166 uc002ltx.4 chr19 1782074 1812275 - 150 100.0 0.25 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (42.67), I9 (57.33), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0) 0.0
22711 ATP8B3 14166 uc002lty.1 chr19 1798760 1806159 - 150 100.0 0.05 0 100.0 E1 (42.67), I1 (57.33), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0) 0.0
22711 ATP8B3 14166 uc002ltz.2 chr19 1798760 1812275 - 150 100.0 0.05 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (42.67), I9 (57.33), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
  • 5 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
22711 chr19 1805919 1805939 tfbsConsSites V$NRSF_01 score:741, zScore:2.22, srow:2415162
22711 chr19 1805946 1805955 tfbsConsSites V$P53_02 score:940, zScore:1.67, srow:2415163
22711 chr19 1805889 1805889 cosmic COSM1391495 srow:551981
22711 chr19 1805896 1805896 cosmic COSM1666821 srow:551982
22711 chr19 1805896 1805896 cosmic COSM1666822 srow:551983
22711 chr19 1805878 1805888 phastConsElements100way lod=71 score:415, srow:4129750
22711 chr19 1805890 1805891 phastConsElements100way lod=31 score:333, srow:4129751
22711 chr19 1805893 1805897 phastConsElements100way lod=40 score:359, srow:4129752
22711 chr19 1805899 1805900 phastConsElements100way lod=21 score:295, srow:4129753
22711 chr19 1805902 1805909 phastConsElements100way lod=92 score:441, srow:4129754
22711 chr19 1805911 1805930 phastConsElements100way lod=203 score:519, srow:4129755
22711 chr19 1805932 1805939 phastConsElements100way lod=65 score:407, srow:4129756
22711 chr19 1805941 1805944 phastConsElements100way lod=36 score:348, srow:4129757
22711 chr19 1805947 1805950 phastConsElements100way lod=38 score:354, srow:4129758
  • 14 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
22711 cellmeth_recounts PrEC: 25, LNCaP: 1, DU145: 4
22711 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=553, B=52, Length=1780, Event=Down, log2FC=-3.41, padj=0
22711 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=553, B=34, Length=1740, Event=Down, log2FC=-4.02, padj=0
22711 cellexp id=ENSG00000130270, name=ATP8B3, PrEC=43, str=224, LNCaP=92, str=29, DU145=2057, str=1124
22711 tcgaexp gene=ATP8B3, entrez=148229, pos=chr19:1782074-1812275(-), B=32, L=31, M=23, H=25