DMR Stats
Positionchr1:2303151-2303350 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesMORN1 (0bp away)
ANODEV p-value0.00563861173118
FrequenciesBenign: 4.0 (57.14%), Low: 6.0 (100.0%), High: 6.0 (66.67 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
24 MORN1 99 uc001ajb.1 chr1 2252696 2322993 - 200 100.0 6.9 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (100), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
24 MORN1 99 uc001ajd.1 chr1 2286616 2322993 - 200 100.0 0.6 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (100), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
24 MORN1 99 uc009vld.3 chr1 2263565 2322993 - 200 100.0 4.68 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
24 chr1 2302160 2304159 cpgShore values(x.gr)[overs$srow, ]:300
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
24 cellmeth_recounts PrEC: 11, LNCaP: 6, DU145: 27
24 cellexp id=ENSG00000116151, name=MORN1, PrEC=59, str=110, LNCaP=366, str=166, DU145=90, str=55
24 tcgaexp gene=SRSF10, entrez=10772, pos=chr1:36273-24306953(-), B=3487, L=3388, M=3432, H=4019
24 tcgaexp gene=MORN1, entrez=79906, pos=chr1:2252696-2322993(-), B=219, L=217, M=237, H=224
24 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305