DMR 2403 chr4:121808901-121809050 (150bp)

DMR Stats
Positionchr4:121808901-121809050 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesPRDM5 (0bp away)
ANODEV p-value0.00548806677606
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 4.0 (66.67%), High: 0.0 (0.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
2403 PRDM5 22006 uc003idn.3 chr4 121615929 121844013 - 150 100.0 0.56 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0) 0.0
2403 PRDM5 22006 uc003ido.3 chr4 121615929 121844013 - 150 100.0 0.56 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
2403 PRDM5 22006 uc003idp.1 chr4 121758500 121844013 - 150 100.0 0.56 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0) 0.0
2403 PRDM5 22006 uc010ine.3 chr4 121615929 121844013 - 150 100.0 0.16 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
2403 PRDM5 22006 uc010inf.3 chr4 121737218 121844013 - 150 100.0 0.36 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0) 0.0
  • 5 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
2403 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 0, DU145: 5
2403 cellexp id=ENSG00000138738, name=PRDM5, PrEC=793, str=307, LNCaP=2, str=1, DU145=477, str=555
2403 tcgaexp gene=PRDM5, entrez=11107, pos=chr4:121615929-121844013(-), B=262, L=112, M=122, H=118
2403 tcgaexp gene=DUX4L5, entrez=653545, pos=chr4:72836-191010142(+), B=0, L=0, M=0, H=0