DMR 24702 chrX:69515201-69515350 (150bp)

DMR Stats
PositionchrX:69515201-69515350 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesKIF4A (0bp away)
ANODEV p-value0.00341169631577
FrequenciesBenign: 5.0 (71.43%), Low: 1.0 (16.67%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
24702 KIF4A 31019 uc004dyf.2 chrX 69509879 69596068 + 150 100.0 1.29 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
24702 KIF4A 31019 uc004dyg.3 chrX 69509879 69640774 + 150 100.0 1.71 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0) 0.0
24702 KIF4A 31019 uc010nkw.3 chrX 69509933 69640774 + 150 100.0 1.29 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
24702 chrX 69515322 69515338 phastConsElements100way lod=14 score:255, srow:9790566
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
24702 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 3, DU145: 5
24702 cellexp id=ENSG00000090889, name=KIF4A, PrEC=3419, str=133, LNCaP=1547, str=2606, DU145=3402, str=4570
24702 tcgaexp gene=IL9R, entrez=3581, pos=chrX:59330252-155240482(+), B=6, L=4, M=6, H=9
24702 tcgaexp gene=VAMP7, entrez=6845, pos=chrX:59213949-155173433(+), B=2541, L=2446, M=2565, H=2891
24702 tcgaexp gene=SPRY3, entrez=10251, pos=chrX:59100457-155012117(+), B=156, L=117, M=100, H=75
24702 tcgaexp gene=KIF4A, entrez=24137, pos=chrX:69509879-69640774(+), B=69, L=108, M=163, H=451