DMR Stats
Positionchr1:3600601-3600800 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesTP73 (0bp away)
ANODEV p-value0.0204628446996
FrequenciesBenign: 2.0 (28.57%), Low: 6.0 (100.0%), High: 6.0 (66.67 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
24918 TP73 124 uc001akp.3 chr1 3569129 3652765 + 200 100.0 0.29 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
24918 TP73 124 uc021ofb.1 chr1 3569129 3652765 + 200 100.0 0.92 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
24918 TP73 124 uc021ofc.1 chr1 3569129 3652765 + 200 100.0 0.35 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
24918 TP73 124 uc021ofd.1 chr1 3569129 3652765 + 200 100.0 0.75 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
24918 TP73 124 uc021ofe.1 chr1 3569129 3652765 + 200 100.0 0.75 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
24918 TP73 124 uc021off.1 chr1 3569129 3652765 + 200 100.0 0.75 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
  • 6 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
24918 chr1 3600666 3601135 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 28 score:1000, srow:2870
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
24918 cellmeth_recounts PrEC: 19, LNCaP: 9, DU145: 3
24918 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=44, B=8, Length=380, Event=Down, log2FC=-2.46, padj=9.10496477952764e-06
24918 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=44, B=3, Length=400, Event=Down, log2FC=-3.87, padj=6.54936536135097e-09
24918 cellexp id=ENSG00000078900, name=TP73, PrEC=67, str=27, LNCaP=532, str=348, DU145=65, str=27
24918 tcgameth site:cg17163168, B=0.37, L=0.66, H=0.59
24918 tcgaexp gene=TP73, entrez=7161, pos=chr1:3569129-3652765(+), B=296, L=155, M=180, H=163
24918 tcgaexp gene=SRSF10, entrez=10772, pos=chr1:36273-24306953(-), B=3487, L=3388, M=3432, H=4019
24918 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305